在對基層行政事業(yè)單位的經常性審計發(fā)現(xiàn)，基層行政事業(yè)單位會計核算中存在的問題主要表現(xiàn)以下幾個方面：
1、會計機構設置簡單、專職會計人員少
由于受經費和人員限制，一些基層行政事業(yè)單位會計機構設置簡單，缺乏必要的內部稽核制度，有些單位會計人員只有一人，即是會計又是出納，既管帳又管錢，會計核算缺乏必要的監(jiān)督，出現(xiàn)了會計帳薄不健全，會計科目設置簡單的現(xiàn)象。
2、內控制度不嚴
由于基層行政事業(yè)單位會計人員少，分工不細，內控制度薄弱，制度執(zhí)行帶有隨意性，存在坐支收入，大額付現(xiàn)，不合規(guī)票據(jù)列支等較為普遍的違規(guī)現(xiàn)象。
3、固定資產管理問題嚴重
一些基層行政事業(yè)單位不重視固定資產的管理，對資產的購置、核銷、登記、保管無明確的制度，對新增和減少的固定資產不能及時建帳和核銷，造成單位財產不清，家底不明，固定資產流失嚴重。
上述問題的存在，不利于基層行政事業(yè)單位的發(fā)展，因此加強基層行政事業(yè)單位核算管理也是真正執(zhí)行《會計法》的必要措施。為此，審計建議：
1、 建議行政主管部門加大公共財政支出改革力度，完善會計核算制度，擴大單位范圍，盡可能地把基層行政事業(yè)單位的財務工作納入會計結算中心統(tǒng)一核算，同時強化核算職能，改變結算中心只核算不監(jiān)督和服務弊端。
2、 基層行政事業(yè)單位要根據(jù)需要設置會計機構，建立內部稽核制度，記賬人員與經濟業(yè)務事項和會計事項的審計人員，財務保管人員的職責權限應當明確，并相互分離，相互制約。
3、要不斷提高會計人員的素質，抓好會計人員的繼續(xù)教育培訓工作，引進競爭機制，加強對會計人員的監(jiān)督和考核，實現(xiàn)會計人員持證上崗。
4、 加強基層單位的固定資產，建立完善的固定資產管理制度和實物資產備查帳，實行專人負責，避免國有資產的流失。
