“十一五”期間，特別是在全國及全區(qū)科技大會召開之后，自治區(qū)黨委、政府做出了建設創(chuàng)新型內(nèi)蒙古，加大科技投入的決定，自治區(qū)本級財政大幅度加大了對科技投入的力度，應用技術研究與開發(fā)資金在穩(wěn)步增長基礎上，2007年新設立自治區(qū)科技創(chuàng)新引導獎勵資金，采取無償補助和有償支持相結合的支持方式對高新技術產(chǎn)業(yè)化項目給予支持，使自治區(qū)本級科技專項資金從2006年的8937萬元增加到2009年的38861萬元，增幅達到335%。

　　其中：應用技術研究與開發(fā)資金（科技三項費）從2006年的8937增加到2009年的18561萬元，增幅108%；

　　科技創(chuàng)新引導獎勵資金從2007年新設立投入的11063萬元，增加到2008年的16243萬元和2009年的18000萬元，其中三年用于無償補助資金25306萬元，有償支持資金20000萬元；

　　另外，自治區(qū)財政改變了以往自然科學基金和知識產(chǎn)權專項資金裹在應用技術研究與開發(fā)資金的管理模式，從2008年開始將自然科學基金和知識產(chǎn)權專項資金單獨列為預算，每年分別投入1000萬元和500萬元。