新型牧區(qū)合作醫(yī)療制度是東蘇旗實施的重點民生工程之一，中央和地方對新型牧區(qū)合作醫(yī)療補助資金投入的力度很大，補助資金從中央到地方逐年增加。中央、自治區(qū)、錫盟和我旗補助資金分別由2007年的20元、15元、5元、10元逐步提高2010年的60元、50元、15元和15元。

　　在2009年我旗新型牧區(qū)合作醫(yī)療基金收入的構(gòu)成中，中央和自治區(qū)新型牧區(qū)合作醫(yī)療補助資金分別占總資金的32%和33.7%，兩項合計65.7%，占一半以上。2009年我旗牧區(qū)合作醫(yī)療基金總?cè)霝?，020，839.35元，其中：牧民個人繳費收入為282，000.00元，占總收入的14%；中央補助收入為648，500.00，占總收入的32%，是牧民個人繳費額的2.3倍；自治區(qū)補助收入為680，000.00元，占總收入的33.7%，是牧民個人繳費額的2.4倍；盟級補助收入169，800.00元，占總收入的8%；地方財政補助179，000.00元，占總收入的8.8%；醫(yī)療救助收入為57，580.00元，占總收入的2.9%；利息收入為3959.35元，占總收入的0.6%。

　　東蘇旗審計局對新型牧區(qū)合作醫(yī)療基金審計調(diào)查結(jié)果表明：新型牧區(qū)合作醫(yī)療制度將使牧民群眾得到越來越多的實惠。