由于我國市場經(jīng)濟體系還不完善，相關(guān)法制還不健全，企業(yè)在經(jīng)濟活動中常常為了保證企業(yè)正常運轉(zhuǎn)和保全企業(yè)的經(jīng)濟利益，在相關(guān)合同增加保護性條款——合同違約金。
而我國合同實行的是補償性違約金，違約金是對違約造成損失的提前確定。違約金有補償性、懲罰性兩種，補償性違約金是對違約行為造成損失的彌補；懲罰性違約金是對違約方違約行為的懲戒，不以損失是否存在為依據(jù)，也只有在懲罰性違約金中，才存在懲罰違約行為與解除合同并存（不適用于我國合同法中）。
我國《合同法》規(guī)定，當事人可以在合同中約定一定數(shù)額的違約金或違約金計算方法，但如約定違約金低于造成的損失，一方可以請求人民法院或仲裁機構(gòu)予以增加；如約定違約金過高于造成損失，當事人可以請求人民法院或仲裁機構(gòu)予以適當減少。說明當事人對違約金的處分權(quán)雖應(yīng)受到尊重，但并非沒有度，而是不能“過高”或“低于”（合同法司法解釋之二定為30%），即違約金只是當事人對違約行為可能造成損失的事前預定，可見我國合同經(jīng)濟法所實行的是補償性違約金，而不是懲罰性違約金。
《企業(yè)所得稅法實施條例》第三十三條規(guī)定：企業(yè)所得稅法第八條所稱其他支出，是指除成本、費用、稅金、損失外，企業(yè)在生產(chǎn)經(jīng)營活動中發(fā)生的與生產(chǎn)經(jīng)營活動有關(guān)的、合理的支出。納稅人按照經(jīng)濟合同規(guī)定支付的違約金屬于與生產(chǎn)經(jīng)營活動有關(guān)的、合理的其他支出。
所謂非行政性、非司法罰金則是根據(jù)經(jīng)濟合同或行業(yè)慣例，對企業(yè)在經(jīng)營活動中的違約行為給予的懲罰并且做出罰款、罰金決定裁定的主體應(yīng)該是行政機關(guān)或者司法機關(guān)（對約定無異議則授權(quán)雙方自行協(xié)商解決）。根據(jù)我國相關(guān)經(jīng)濟法規(guī)，企業(yè)無權(quán)向其他企業(yè)和個人進行罰款，尤其是合同懲罰性的違約金必須提請法院及仲裁機構(gòu)執(zhí)行裁定，一般企業(yè)怕麻煩自行協(xié)商解決，因此少了個法律程序，所以只能協(xié)商解決了賠款的金額卻協(xié)商解決不了票據(jù)的問題，由于這類合同懲罰性違約金取得票據(jù)手續(xù)比較繁雜，企業(yè)通常將這類合同違約金并入流轉(zhuǎn)稅中進行處理，以求取得稅前扣除票據(jù)的方便。
根據(jù)稅法的稅前扣除的原則和要求，接合企業(yè)經(jīng)濟合同的特點，現(xiàn)將正確的涉稅處理說明如下：
一、銷售貨物合同（增值稅）、提供勞務(wù)服務(wù)及銷售不動產(chǎn)合同（營業(yè)稅）中的違約金
1、購貨方向銷售方支付的違約金
屬于增值稅業(yè)務(wù)的價外費用，應(yīng)該并入增值稅發(fā)票中，同時確認為企業(yè)的銷售收入，作為主營業(yè)務(wù)收入。
依據(jù)《增值稅條例實施細則》第十二條 條例第六條第一款所稱價外費用，包括價外向購買方收取的手續(xù)費、補貼、基金、集資費、返還利潤、獎勵費、違約金、滯納金、延期付款利息、賠償金、代收款項、代墊款項、包裝費、包裝物租金、儲備費、優(yōu)質(zhì)費、運輸裝卸費以及其他各種性質(zhì)的價外收費。
2、接受勞務(wù)方向提供勞務(wù)方支付的違約金
屬于營業(yè)稅業(yè)務(wù)的價外費用，應(yīng)該并入營業(yè)稅發(fā)票中，同時確認為企業(yè)的營業(yè)收入，作為主營業(yè)務(wù)收入。
依據(jù)《營業(yè)稅條例實施細則》第十三條 條例第五條所稱價外費用，包括收取的手續(xù)費、補貼、基金、集資費、返還利潤、獎勵費、違約金、滯納金、延期付款利息、賠償金、代收款項、代墊款項、罰息及其他各種性質(zhì)的價外收費。
3、銷售（提供勞務(wù)）方向購貨（接受勞務(wù)）方支付的違約金；
依據(jù)《關(guān)于商業(yè)企業(yè)向貨物供應(yīng)方收取的部分費用征收流轉(zhuǎn)稅問題的通知》國稅發(fā)[2004]136號的處理辦法處理：與商品銷售量、銷售額有聯(lián)系的征收合同約定相應(yīng)的流轉(zhuǎn)稅；與商品銷售量、銷售額無聯(lián)系的一律征收營業(yè)稅才能進行稅前扣除。
4、沒有產(chǎn)生合同約定的交易，按照合同約定支付（雙向）的違約金
應(yīng)該屬于定金的性質(zhì)，適用于定金擔保條款，即使合同中同時約定了定金條款和違約金條款。收受定金一方以雙倍返還定金就對違約方進行了懲罰，在這種情況下即便合同還訂有違約金條款，違約方也可拒付違約金，這是根據(jù)我國《合同法》規(guī)定，當合同中同時訂有定金和違約金條款時，一方違約只能選擇其中之一適用。
因此支付的這種定金性質(zhì)的違約金不是價外費用，也不屬于征收流轉(zhuǎn)稅范圍，所以在這種情況下的違約支出，不需要取得流轉(zhuǎn)稅發(fā)票，但是必須取得由收取方提供的合法、合理的依據(jù)，借此證明和判斷賠償行為的真實存在和進行會計及稅務(wù)處理。具體的是依據(jù)法院判決書或調(diào)解書、仲裁機構(gòu)的裁定書、雙方簽訂的合同協(xié)議、付款證明、收款方開具符合發(fā)票管理規(guī)定的相關(guān)票據(jù)稅前扣除（相關(guān)票據(jù)也可以借鑒國稅發(fā)（2004）136號的處理辦法處理）。也可以到財政部門或稅務(wù)機關(guān)取得非營業(yè)收入專用發(fā)票。
為什么企業(yè)支付這種違約金必須有合法票據(jù)才能在稅前扣除呢？因為常常有些公司將正常盈利的利潤，開幾張合同違約金收據(jù)全部沖銷掉（這種沒有執(zhí)行的合同隨便就能制作）。
二、勞動合同的違約金
屬于個人所得稅的業(yè)務(wù)，屬于企業(yè)的職工薪酬（辭退福利），應(yīng)該作企業(yè)的負債（費用）處理，如果符合稅收規(guī)定的還應(yīng)該代繳個人所得稅（或營業(yè)稅），同時確認為企業(yè)相關(guān)費用。以支付憑證和對方身份證明或者完稅證（復印件）作為入賬依據(jù)稅前扣除。