對增值稅一般納稅人進行納稅評估，稅負率是重要的評價指標(biāo)，稅務(wù)機關(guān)和納稅人都需要分析企業(yè)的稅負率是否合理。實行金稅工程以后，稅務(wù)機關(guān)獲取行業(yè)平均數(shù)據(jù)比較容易，但如何把握不同企業(yè)之間的個體差異難度比較大。分析企業(yè)稅負率的合理性必須從企業(yè)的經(jīng)營特征入手，生產(chǎn)相同產(chǎn)品的企業(yè)，由于生產(chǎn)經(jīng)營方式不同，稅負率會有比較大的差異。具體分析可以從以下幾點著手：
1、分析企業(yè)的價值鏈
制造企業(yè)的價值鏈通過包括了研發(fā)設(shè)計、采購、生產(chǎn)制造、銷售、運輸、售后服務(wù)、行政人力資源等部分。對于一個獨立的企業(yè)，往往內(nèi)部囊括了以上價值鏈的全部，各個部分產(chǎn)生的增加值在同一家公司匯集，企業(yè)稅負比較高。對于集團公司，內(nèi)部價值鏈各個部分可能是分開的，因此，每家企業(yè)的增值稅稅負比較低。
2、分析企業(yè)的生產(chǎn)方式
企業(yè)的加工費用包括了折舊、人工、輔助生產(chǎn)的費用，這些費用都沒有對應(yīng)的進項可以抵扣。但如果企業(yè)將部分產(chǎn)品發(fā)外加工，對方開具專用發(fā)票，這些加工費就產(chǎn)生了進項，企業(yè)銷售額相同的情況下，交納的增值稅減少，稅負下降。企業(yè)高速成長過程中，選擇發(fā)外加工模式的情況很普遍，所以分析稅負率時，要分析企業(yè)是否存在發(fā)外加工的情況。
3、分析企業(yè)的運輸方式
現(xiàn)在企業(yè)銷售產(chǎn)品往往是送貨到對方的倉庫，運輸成本比較高。運輸費用的處理有不同的方式，我們比較兩種常見方式的稅負差異：一是買方承擔(dān)，運輸公司直接開具發(fā)票給買方；一是賣方承擔(dān)，運輸公司直接開具發(fā)票給賣方。
4、分析企業(yè)產(chǎn)品的市場定位
現(xiàn)在分析稅負時比較強調(diào)同行業(yè)比較。其實，同一行業(yè)的企業(yè)在市場中的定位往往不同。有些企業(yè)樹立品牌形象，走高端路線，產(chǎn)品品質(zhì)好，銷售價格貴。有些產(chǎn)品重視低成本運作，重視大眾市場，市場容量大，贏在薄利多銷。由于市場地位不同，產(chǎn)品的毛利不一樣，利潤是增值額的一部分，利潤越高，稅負越高。因此同一行業(yè)中，做高端產(chǎn)品的企業(yè)稅負比較高，做低端產(chǎn)品的企業(yè)稅負比較低。
5、分析企業(yè)的銷售策略
影響增值稅稅負的因素還包括企業(yè)的銷售策略。基本的營銷策略有兩種：一種是推動式。方式的特點是給予經(jīng)銷商大的折扣、優(yōu)惠、返點、獎勵，靠經(jīng)銷商來推動市場。另一種是拉動式。方式特點是通過品牌運作、廣告投入、營銷活動使最終消費者對產(chǎn)品認同、產(chǎn)生好感，拉動市場，對經(jīng)銷商沒有特別的獎勵和優(yōu)惠。