在企業(yè)之間轉讓合同的情況下，轉讓費應該由運用《商業(yè)合同法》的規(guī)定，雙方簽訂書面協議訂立，金額明確。根據《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》規(guī)定，企業(yè)應繳納轉讓費所得稅。一般情況下，轉讓費應當使用工商銀行企業(yè)賬戶，經營和收入可以計入企業(yè)收入，應繳納25%的企業(yè)所得稅；新公司收取的轉讓費也應繳納企業(yè)所得稅。同時，新公司和原公司之間的收入和支出都應在收入中稅前進行登記，準確統(tǒng)計收入支出，及時填寫納稅申報表。
拓展知識： 稅務機關將對轉讓合同金額進行核查，以確認繳納稅款范圍，并要求準確登記雙方之間的收入和支出，確保稅款正確繳納。此外，新成立的公司應登記到稅務機關，按照法定程序了解并遵守相關的稅務規(guī)定，以確保正確繳納企業(yè)所得稅。