所得稅匯算實際上是對單位全部納稅情況的一次全面檢查。所得稅檢查既查納稅情況，又涉及公司的財務(wù)管理、財務(wù)核算等，政策性強(qiáng)、涉及面廣、工作量大。人們常說：“凡事預(yù)則立，不預(yù)則廢”。做好匯算清繳前的準(zhǔn)備工作，在申報中有的放矢，才能事半功倍。
一、全面了解單位的基本情況是搞好企業(yè)所得稅匯算檢查的基礎(chǔ)
企業(yè)所得稅匯算涉及單位生產(chǎn)經(jīng)營的各個環(huán)節(jié)，了解單位全貌將有助于全面掌握單位的基本情況。主要了解單位的經(jīng)營歷史，經(jīng)營狀況、業(yè)務(wù)類型、經(jīng)營現(xiàn)狀、主要業(yè)務(wù)及主要的銷貨方、供貨方，各類資產(chǎn)的形式、主要存放地，單位職工概況，總體文化程度，企業(yè)文化等。
二、詳細(xì)閱讀研究年度財務(wù)會計報表、財務(wù)說明、企業(yè)所得稅申報表，并與以前年度比對，是搞好企業(yè)所得稅匯算的關(guān)鍵
單位年度財務(wù)會計報表、財務(wù)說明和單位年度所得稅申報表是對單位全年經(jīng)營情況的總體反映，是單位經(jīng)營成果的集中體現(xiàn)。要了解被查單位與稅收相關(guān)的財務(wù)指標(biāo)，重點了解一些重要的財務(wù)指標(biāo)，既包括絕對數(shù)指標(biāo)，也包括相對數(shù)指標(biāo)，發(fā)現(xiàn)其中的差異，作為檢查的重點，如：銷售收入利潤率（稅前利潤/銷售收入*100%）、生產(chǎn)成本銷售率（銷售收入/生產(chǎn)成本*100%）、固定資產(chǎn)繳納房產(chǎn)稅率（已繳房產(chǎn)稅/固定資產(chǎn)總額*100%）等涉稅指標(biāo)，將這些指標(biāo)與單位歷史數(shù)據(jù)、當(dāng)期同行業(yè)平均水平進(jìn)行比較，如出現(xiàn)大起大落、或長期始終保持一個比較穩(wěn)定的數(shù)值，則有深查的必要。
三、對有關(guān)的稅收法律、法規(guī)、規(guī)章和相關(guān)財務(wù)會計知識的學(xué)習(xí)是搞好企業(yè)所得稅匯算的重點
“磨刀不誤砍柴工”。對涉及單位有關(guān)的稅收政策進(jìn)行全面系統(tǒng)的學(xué)習(xí)掌握，對單位應(yīng)繳稅種、適用的稅目、稅率，如何確定計稅依據(jù)等，要做到政策清楚、條款熟悉，全面熟悉掌握涉及單位相關(guān)的稅收法律、法規(guī)、規(guī)章等。針對單位的經(jīng)營特點組織組成員學(xué)習(xí)相關(guān)的財務(wù)會計知識，以提高檢查的有效性和針對性。如行政許可法實施后，取消部分行政審批，由被查單位自行提取費用、稅前彌補等。
四、與單位的稅務(wù)管理員、調(diào)閱單位的歷史檢查材料和審計報告、與財務(wù)人員及其他有關(guān)人員作深入交流，是搞好企業(yè)所得稅匯算的必經(jīng)程序
通過與單位的稅務(wù)管理員進(jìn)行交流，可能發(fā)現(xiàn)問題，估計單位可能出現(xiàn)的問題。特別行業(yè)的有關(guān)稅收共性問題，行業(yè)其他單位的稅收理解。
單位的歷史檢查資料較為全面地反映了稅務(wù)機(jī)關(guān)在歷年的稅務(wù)檢查中已發(fā)現(xiàn)的問題，了解單位歷年查出的問題，從而確定單位目前仍然可能存在的問題。特別是稽查局稽查的結(jié)論，還應(yīng)查閱會計師事務(wù)所的審計報告和內(nèi)部審計的審計報千，對上述資料應(yīng)進(jìn)行詳細(xì)的閱讀，上面載明了歷年檢查中的詳細(xì)情況，而內(nèi)審報告則從內(nèi)審的角度說明單位本身存在的一些基本情況，會計師事務(wù)所的審計報告則從更加專業(yè)、全面如實反映單位的資產(chǎn)、經(jīng)營及結(jié)果的角度進(jìn)行反映，從中發(fā)現(xiàn)單位可能存在的問題。
重點詳細(xì)了解單位財務(wù)核算流程，從單位財務(wù)核流程中發(fā)現(xiàn)可能存在的問題，了解單位的財務(wù)會計核辦法，對在當(dāng)年度有特殊財務(wù)處理或意外情況發(fā)生應(yīng)重點向財務(wù)人員加以了解情況等。如：單位改制、折舊辦法的改變、各類減值準(zhǔn)備的計提以及各類稅款的計稅依據(jù)的確定、稅種、稅目、稅率的適用等。
根據(jù)單位經(jīng)營規(guī)模的大小、經(jīng)營業(yè)務(wù)的復(fù)雜狀況、財務(wù)處理的復(fù)雜程度等來決定簡化相應(yīng)的企業(yè)所得稅匯算檢查前的準(zhǔn)備工作。