日前，國家稅務(wù)總局發(fā)布了《關(guān)于調(diào)整增值稅扣稅憑證抵扣期限有關(guān)問題的通知》（國稅函[2009]617號），決定自2010年1月1日起，調(diào)整增值稅專用發(fā)票等扣稅憑證抵扣期限，由90天延長至180天。
認證期限延長至半年
由于原有的抵扣期限偏短，給企業(yè)造成了一些負擔(dān)。近期國家稅務(wù)總局制定了具體的措施，對稅收征管工作進行了實質(zhì)性的、傾向于納稅人的改進。
比如對于取得增值稅專用發(fā)票、公路內(nèi)河貨物運輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票和機動車銷售統(tǒng)一發(fā)票，國稅函[2009]617號文件第一條規(guī)定，增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的增值稅專用發(fā)票、公路內(nèi)河貨物運輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票和機動車銷售統(tǒng)一發(fā)票，應(yīng)在開具之日起180天內(nèi)到稅務(wù)機關(guān)辦理認證，并在認證通過的次月申報期內(nèi)，向主管稅務(wù)機關(guān)申報抵扣進項稅額。文件提醒，上述規(guī)定要從2010年1月1日起執(zhí)行。對納稅人取得2009年12月31日以前開具的增值稅扣稅憑證，仍按原來規(guī)定執(zhí)行，還是遵照《國家稅務(wù)總局關(guān)于增值稅一般納稅人取得防偽稅控系統(tǒng)開具的增值稅專用發(fā)票進項稅額抵扣問題的通知》（國稅發(fā)[2003]17號）第一條規(guī)定來執(zhí)行，對增值稅一般納稅人申請抵扣的防偽稅控系統(tǒng)開具的增值稅專用發(fā)票，必須自該專用發(fā)票開具之日起90天內(nèi)到稅務(wù)機關(guān)認證，否則不予抵扣進項稅額。舉例說明，一般納稅人取得2009年12月31日開具的增值稅專用發(fā)票，必須在2010年3月31日前認證入賬（2010年是閏年），并在認證的當(dāng)月申報抵扣才有效。如果一般納稅人取得2010年1月1日開具的增值稅專用發(fā)票，就可以在2010年6月30日前認證并入賬，并在認證的當(dāng)月抵扣進項，在7月15日征期結(jié)束前增值稅納稅申報時體現(xiàn)出來。
對取得海關(guān)進口增值稅專用繳款書的，國稅函[2009]617號文件第二條規(guī)定，實行海關(guān)進口增值稅專用繳款書（以下簡稱海關(guān)繳款書）“先比對后抵扣”管理辦法的增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的海關(guān)繳款書，應(yīng)在開具之日起180日內(nèi)向主管稅務(wù)機關(guān)報送《海關(guān)完稅憑證抵扣清單》（包括紙質(zhì)資料和電子數(shù)據(jù)）申請稽核比對。未實行海關(guān)繳款書“先比對后抵扣”管理辦法的增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的海關(guān)繳款書，應(yīng)在開具之日起180天后的第一個納稅申報期結(jié)束以前，向主管稅務(wù)機關(guān)申報抵扣進項稅額。
需要特別關(guān)注的是，未實行海關(guān)繳款書“先比對后抵扣”管理辦法的增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的海關(guān)繳款書，假定180天剛好落在2010年7月10日，而6月征期截止日為7月15日，那么此票的抵扣期限為7月15日，而不是7月征期截止日8月15日。如果剛好落在7月18日，那么抵扣期限為7月征期截止日即8月15日。
超期限不得抵扣進項
增值稅一般納稅人未在規(guī)定期限內(nèi)到稅務(wù)機關(guān)辦理認證、申報抵扣或者申請稽核比對的，將無法作為合法的增值稅扣稅憑證，不能計算進項稅額抵扣。國稅發(fā)[2003]17號文件第二條規(guī)定，增值稅一般納稅人認證通過的防偽稅控系統(tǒng)開具的增值稅專用發(fā)票，應(yīng)在認證通過的當(dāng)月按照增值稅有關(guān)規(guī)定核算當(dāng)期進項稅額并申報抵扣，否則不予抵扣進項稅額，國稅函[2009]617號文件再次強調(diào)了超過期限未認證抵扣的憑證不能作為進項稅款抵扣的政策，要求在認證通過的次月申報期內(nèi)，向主管稅務(wù)機關(guān)申報抵扣進項稅額，這與認證當(dāng)月抵扣是一個意思。國稅函[2009]617號文件第三條規(guī)定，增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的增值稅專用發(fā)票、公路內(nèi)河貨物運輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票、機動車銷售統(tǒng)一發(fā)票以及海關(guān)繳款書，未在規(guī)定期限內(nèi)到稅務(wù)機關(guān)辦理認證、申報抵扣或者申請稽核比對的，不得作為合法的增值稅扣稅憑證，不得計算進項稅額抵扣。此政策看做是對原有條款的保留，而且對于超過認證期限的進項憑證，納稅人也不能返還銷貨方作廢重開，只能作為財務(wù)上的記賬憑證了，未抵扣的進項稅額應(yīng)該同購入的貨物價款一并計入貨物成本，在結(jié)轉(zhuǎn)收入時同比結(jié)轉(zhuǎn)銷售成本并在企業(yè)所得稅前進行扣除。
丟失抵扣憑證按原規(guī)定執(zhí)行
國稅函[2009]617號文件第四條規(guī)定，增值稅一般納稅人丟失已開具的增值稅專用發(fā)票，應(yīng)在規(guī)定期限內(nèi)，按照《國家稅務(wù)總局關(guān)于修訂〈增值稅專用發(fā)票使用規(guī)定〉的通知》（國稅發(fā)[2006]156號）第二十八條及相關(guān)規(guī)定辦理。如果一般納稅人丟失前已認證相符的，購買方憑銷售方提供的相應(yīng)專用發(fā)票記賬聯(lián)復(fù)印件及銷售方所在地主管稅務(wù)機關(guān)出具的《丟失增值稅專用發(fā)票已報稅證明單》，經(jīng)購買方主管稅務(wù)機關(guān)審核同意后，可作為增值稅進項稅額的抵扣憑證。如果丟失前未認證的，購買方憑銷售方提供的相應(yīng)專用發(fā)票記賬聯(lián)復(fù)印件到主管稅務(wù)機關(guān)進行認證，認證相符的憑該專用發(fā)票記賬聯(lián)復(fù)印件及銷售方所在地主管稅務(wù)機關(guān)出具的《丟失增值稅專用發(fā)票已報稅證明單》，經(jīng)購買方主管稅務(wù)機關(guān)審核同意后，可作為增值稅進項稅額的抵扣憑證。
增值稅一般納稅人丟失海關(guān)繳款書，應(yīng)在規(guī)定期限內(nèi)，憑報關(guān)地海關(guān)出具的相關(guān)已完稅證明，向主管稅務(wù)機關(guān)提出抵扣申請。主管稅務(wù)機關(guān)受理申請后，應(yīng)當(dāng)進行審核，并將納稅人提供的海關(guān)繳款書電子數(shù)據(jù)納入稽核系統(tǒng)進行比對。稽核比對無誤后，方可允許計算進項稅額抵扣。