事業(yè)單位領(lǐng)導(dǎo)干部經(jīng)濟責(zé)任審計，要對其經(jīng)濟責(zé)任的履行情況進行全面的審查評價，因此，審計的內(nèi)容主要取決于領(lǐng)導(dǎo)干部在單位中的地位及其應(yīng)履行的職責(zé)，主要包括被審計領(lǐng)導(dǎo)干部所在單位有無建立適當(dāng)?shù)膬?nèi)部控制制度，財務(wù)收支活動是否真實、合法，資產(chǎn)負(fù)債是否真實、完整，主要業(yè)務(wù)、經(jīng)濟指標(biāo)是否完成，有無違反財經(jīng)法紀(jì)與廉政規(guī)定。

　　（1）內(nèi)部控制制度的審計。

　　現(xiàn)代內(nèi)部控制制度不僅適合于手工操作的信息系統(tǒng)，同樣也適合于電算化系統(tǒng)；不僅適合于企業(yè)單位，同樣也適合于事業(yè)單位和政府部門。任何單位要想進行規(guī)范、有效的管理，必須要健全和實施內(nèi)部控制制度。建立和執(zhí)行內(nèi)部控制制度是管理者的責(zé)任，更是單位領(lǐng)導(dǎo)者的責(zé)任。對事業(yè)單位黨政領(lǐng)導(dǎo)進行經(jīng)濟責(zé)任審計時，首先就應(yīng)查明被審計領(lǐng)導(dǎo)所在單位有無健全的內(nèi)部控制制度，各項內(nèi)部控制制度是否得到很好的貫徹執(zhí)行，機構(gòu)設(shè)置、崗位設(shè)定、職責(zé)劃分、人員定位、業(yè)務(wù)處理、作業(yè)程序、資產(chǎn)管理、收支手續(xù)等是否符合內(nèi)部控制制度的規(guī)定，有無因失控或控制不嚴(yán)而造成管理混亂、損失浪費、差錯舞弊等現(xiàn)象的發(fā)生。對事業(yè)單位內(nèi)部控制制度進行審計的內(nèi)容主要包括管理控制和社會控制兩個方面。

　?。?）財務(wù)收支活動是否真實、合法。

　　根據(jù)目前我國大多數(shù)事業(yè)單位管理狀況，對事業(yè)單位進行財務(wù)收支活動審計時，應(yīng)在內(nèi)部控制制度一般性審計的基礎(chǔ)上，重點查明會計控制制度建立與實施狀況，即

　　首先要查明被審計的事業(yè)單位有無健全的會計機構(gòu)和核算體系，有無必要的會計制度或會計管理規(guī)定，有無建立完善的賬簿體系和會計報告體系，有無內(nèi)部稽核或內(nèi)部審計組織，或者有無專門從事復(fù)核與審查的人員。

　　其次，檢查各種作業(yè)（包括會計業(yè)務(wù)處理）有無健全的操作程序和規(guī)定應(yīng)辦理的手續(xù)，特別在經(jīng)濟收支程序中有無貫徹不相容職務(wù)分離的原則，有無一個部門或一個人包攬重要經(jīng)濟收支的全部過程。

　　第三，檢查各項財政、財務(wù)收支業(yè)務(wù)處理是否符合制度的規(guī)定，有無不按制度規(guī)定或繞過控制處理的現(xiàn)象。

　　第四，檢查會計記錄是否真實、完整地反映了經(jīng)濟收支事項，所記錄的收支事項是否合理、合法，有無真實可靠的原始資料為依據(jù)。

　　第五，檢查財政補助收入是否按國家規(guī)定并按預(yù)算級次反映；各項收費有無報批，是否按核定的標(biāo)準(zhǔn)執(zhí)行；事業(yè)性收費收入與經(jīng)營服務(wù)性收入是否分開核算；"財政專戶"的未來性收費收入是否按規(guī)定繳存，有無坐支挪用現(xiàn)象；經(jīng)營服務(wù)性收入是否按稅法規(guī)定繳納各項稅費；各項收入是否按規(guī)定完整地記入各收入類賬戶，有無用"應(yīng)付賬款"類賬戶截留收入或私設(shè)小金庫。

　　第六，檢查各項支出是否屬實，有無真實、合法的原始憑證為依據(jù)，有無無據(jù)支付或白條支付現(xiàn)象；對于有專門用途的收費是否按規(guī)定用途使用，有無利用收費資金給職工濫發(fā)錢物或違規(guī)建房、購車等問題，結(jié)余是否真實反映；對于支出中發(fā)現(xiàn)的異常現(xiàn)象，應(yīng)重點查明，視其是否真實、合理與合法進行處理。

　　（3）資產(chǎn)、負(fù)債是否真實、完整。

　　目前我國不少事業(yè)單位都存在家底不清，收支不明的問題，很多單位的主要負(fù)責(zé)人并不知道自己管理的單位有多少資產(chǎn)，有多少債權(quán)，有多少債務(wù)，用的錢不知道來源，花的錢不知道去向。對事業(yè)單位黨政領(lǐng)導(dǎo)進行經(jīng)濟責(zé)任審計，理應(yīng)要查明黨政領(lǐng)導(dǎo)所在單位的資產(chǎn)、負(fù)債的真實性和完整程度。

　　（4）各項主要經(jīng)濟指標(biāo)完成情況的審計。

　　事業(yè)單位各項活動的資金來源主要是：財政補助收入、撥入?？钍杖?、事業(yè)收入、經(jīng)營收入和其他收入等。事業(yè)單位領(lǐng)導(dǎo)干部的經(jīng)濟責(zé)任就是管好用好國家撥付或自行組織收入取得的資金。事業(yè)單位領(lǐng)導(dǎo)干部任期經(jīng)濟責(zé)任審計指標(biāo)主要有：資產(chǎn)增長率、資產(chǎn)保值增值率、資產(chǎn)負(fù)債率、經(jīng)費自給率、人員支出比例、公用支出比率、業(yè)務(wù)支出比率、人均費用比率（包括人均支出比率、個人支出比率、人均公用支出比率）、收支結(jié)余率、收入增長率、專用基金增長率、資產(chǎn)創(chuàng)收率、計劃完成率、招待費支出比率、違規(guī)金額比率和財務(wù)處理差錯率等。

　　事業(yè)單位種類繁多，工作性質(zhì)，任務(wù)范圍各有差異，能夠反映事業(yè)單位領(lǐng)導(dǎo)干部任期經(jīng)濟責(zé)任情況的審計指標(biāo)，除了上述通用指標(biāo)外，更多的是具體行業(yè)特點的審計指標(biāo)。

　?。?）遵守財經(jīng)法紀(jì)情況的審計。

　　審計財經(jīng)法紀(jì)情況要以財務(wù)收支的真實性、合法性、效益性為載體。在審計中，如果發(fā)現(xiàn)財務(wù)收支不真實、有違反財經(jīng)法紀(jì)情況的，應(yīng)認(rèn)真核實，并根據(jù)審計結(jié)果作出相應(yīng)的處理和建議。構(gòu)成犯罪的要移交司法部門，依法追究刑事責(zé)任；一般違反財經(jīng)法紀(jì)行為的，應(yīng)按國家法律、法規(guī)作出處理決定和審計建議。

　　（6）個人收入及廉潔自律的情況的審計。

　　事業(yè)單位領(lǐng)導(dǎo)干部的個人收入及廉潔自律情況是經(jīng)濟責(zé)任審計的主要內(nèi)容。通過審計，應(yīng)查明領(lǐng)導(dǎo)干部個人收入的真實性、合法性及廉潔自律情況，并作出客觀、公正、實事求是的評價。