【問】跨地區(qū)經(jīng)營(yíng)的總分支機(jī)構(gòu)，總機(jī)構(gòu)在深圳，有多家分支機(jī)構(gòu)在外地，總機(jī)構(gòu)與各分支機(jī)構(gòu)的企業(yè)所得稅稅率都是不一樣，請(qǐng)問總機(jī)構(gòu)在做年度企業(yè)所得稅申報(bào)時(shí)如何計(jì)算總機(jī)構(gòu)應(yīng)納稅額?
【答】根據(jù)《關(guān)于跨地區(qū)經(jīng)營(yíng)匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理若干問題的通知》（國(guó)稅函[2009]221號(hào)）的規(guī)定，預(yù)繳時(shí)，總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)處于不同稅率地區(qū)的，先由總機(jī)構(gòu)統(tǒng)一計(jì)算全部應(yīng)納稅所得額，然后按照國(guó)稅發(fā)[2008]28號(hào)文件第十九條規(guī)定的比例和第二十三條規(guī)定的三因素及其權(quán)重，計(jì)算劃分不同稅率地區(qū)機(jī)構(gòu)的應(yīng)納稅所得額，再分別按各自的適用稅率計(jì)算應(yīng)納稅額后加總計(jì)算出企業(yè)的應(yīng)納所得稅總額。再按照國(guó)稅發(fā)[2008]28號(hào)文件第十九條規(guī)定的比例和第二十三條規(guī)定的三因素及其權(quán)重，向總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)分?jǐn)偩偷仡A(yù)繳的企業(yè)所得稅款。
匯繳時(shí)，企業(yè)年度應(yīng)納所得稅額應(yīng)按上述方法并采用各分支機(jī)構(gòu)匯算清繳所屬年度的三因素計(jì)算確定。
除《國(guó)務(wù)院關(guān)于實(shí)施企業(yè)所得稅過(guò)渡優(yōu)惠政策的通知》（國(guó)發(fā)[2007]39號(hào)）、《財(cái)政部 國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于企業(yè)所得稅若干優(yōu)惠政策的通知》（財(cái)稅[2008]1號(hào)）和《財(cái)政部 國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于貫徹落實(shí)國(guó)務(wù)院關(guān)于實(shí)施企業(yè)所得稅過(guò)渡優(yōu)惠政策有關(guān)問題的通知》（財(cái)稅[2008]21號(hào)）有關(guān)規(guī)定外，跨地區(qū)經(jīng)營(yíng)匯總納稅企業(yè)不得按照上述總分支機(jī)構(gòu)處于不同稅率地區(qū)的計(jì)算方法計(jì)算并繳納企業(yè)所得稅，應(yīng)按照企業(yè)適用統(tǒng)一的稅率計(jì)算并繳納企業(yè)所得稅。
所以，總分機(jī)構(gòu)適用不同稅率時(shí)，請(qǐng)按文件規(guī)定執(zhí)行。