《企業(yè)所得稅法實施條例》第三十六條規(guī)定，企業(yè)為投資者或者職工支付的商業(yè)保險費不能稅前扣除，但以下兩種商業(yè)保險可以扣除：
（一）企業(yè)依照國家有關(guān)規(guī)定為特殊工種職工支付的人身安全保險費；
（二）國務(wù)院財政、稅務(wù)主管部門規(guī)定可以扣除的其他商業(yè)保險費外。
因此，除了上述可以稅前扣除的商業(yè)保險以外，為全體員工購買的其他商業(yè)保險，不能在企業(yè)所得稅前扣除，即使計入福利費、工資并為員工代扣代繳了個人所得稅，也不能稅前扣除。
二、個人所得稅
《財政部、國家稅務(wù)總局、保監(jiān)會關(guān)于實施商業(yè)健康保險個人所得稅政策試點的通知》（財稅〔2015〕126號）第一條規(guī)定，實施商業(yè)健康保險個人所得稅政策的試點地區(qū)為：
（一）北京市、上海市、天津市、重慶市。
（二）……
第三條規(guī)定，對試點地區(qū)個人購買符合規(guī)定的健康保險產(chǎn)品的支出，按照2400元/年的限額標(biāo)準(zhǔn)在個人所得稅前予以扣除，具體規(guī)定如下：
（一）取得工資薪金所得或連續(xù)性勞務(wù)報酬所得的個人，自行購買符合規(guī)定的健康保險產(chǎn)品的，應(yīng)當(dāng)及時向代扣代繳單位提供保單憑證�？劾U單位自個人提交保單憑證的次月起，在不超過200元/月的標(biāo)準(zhǔn)內(nèi)按月扣除。一年內(nèi)保費金額超過2400元的部分，不得稅前扣除。次年或以后年度續(xù)保時，按上述規(guī)定執(zhí)行。
（二）單位統(tǒng)一組織為員工購買或者單位和個人共同負(fù)擔(dān)購買符合規(guī)定的健康保險產(chǎn)品，單位負(fù)擔(dān)部分應(yīng)當(dāng)實名計入個人工資薪金明細(xì)清單，視同個人購買，并自購買產(chǎn)品次月起，在不超過200元/月的標(biāo)準(zhǔn)內(nèi)按月扣除。一年內(nèi)保費金額超過2400元的部分，不得稅前扣除。次年或以后年度續(xù)保時，按上述規(guī)定執(zhí)行。
（三）個體工商戶業(yè)主、企事業(yè)單位承包承租經(jīng)營者、個人獨資和合伙企業(yè)投資者自行購買符合條件的健康保險產(chǎn)品的，在不超過2400元/年的標(biāo)準(zhǔn)內(nèi)據(jù)實扣除。一年內(nèi)保費金額超過2400元的部分，不得稅前扣除。次年或以后年度續(xù)保時，按上述規(guī)定執(zhí)行。
三、增值稅
《財政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于全面推開營業(yè)稅改征增值稅試點的通知》（財稅〔2016〕36號）附件3：《營業(yè)稅改征增值稅試點過渡政策的規(guī)定》第一條規(guī)定，下列項目免征增值稅……（二十一）保險公司開辦的一年期以上人身保險產(chǎn)品取得的保費收入。
一年期以上人身保險，是指保險期間為一年期及以上返還本利的人壽保險、養(yǎng)老年金保險，以及保險期間為一年期及以上的健康保險。……健康保險，是指以因健康原因?qū)е聯(lián)p失為給付保險金條件的人身保險。
因此，如果單位給職工繳納的商業(yè)保險是保險公司開辦的一年期以上人身保險產(chǎn)品，保險公司取得的保費收入免征增值稅，免稅收入不得開具增值稅專用發(fā)票。除此之外其他類型的保險費可以開具增值稅專用發(fā)票。
因此，上述試點地區(qū)的納稅人，為員工購買的上述規(guī)定標(biāo)準(zhǔn)以內(nèi)的商業(yè)健康保險個人所得稅稅前可以扣除。
