減輕企業(yè)稅費(fèi)負(fù)擔(dān)，是國家支持農(nóng)產(chǎn)品加工業(yè)發(fā)展的重要政策措施。增值稅是農(nóng)產(chǎn)品加工企業(yè)承擔(dān)的主要稅種，在企業(yè)繳納的稅費(fèi)中占到50%以上。一直以來，廣大農(nóng)產(chǎn)品加工企業(yè)對于增值稅進(jìn)項稅抵扣中存在的“高征低扣”問題反映強(qiáng)烈，進(jìn)一步改革完善勢在必行。
一、農(nóng)產(chǎn)品加工業(yè)增值稅歷次調(diào)整及影響
�。ㄒ唬�1994年開始對農(nóng)產(chǎn)品加工企業(yè)征收增值稅。1993年《中華人民共和國增值稅暫行條例》（國務(wù)院令[1993]134號）明確規(guī)定，從1994年1月1日起，境內(nèi)銷售貨物或者提供加工、修理修配勞務(wù)以及進(jìn)口貨物的單位和個人為增值稅的納稅義務(wù)人（以下簡稱納稅人），應(yīng)依照條例繳納增值稅。農(nóng)產(chǎn)品加工企業(yè)成為增值稅的納稅義務(wù)人，稅率為17%.但該條例第二條規(guī)定，糧食、食用植物油、飼料三種產(chǎn)品的適用稅率為13%.“進(jìn)項稅抵扣”是增值稅的一大特點(diǎn)，但鑒于該《條例》第十六條規(guī)定農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者銷售的自產(chǎn)農(nóng)業(yè)產(chǎn)品免征增值稅，加工企業(yè)向農(nóng)民購買其自產(chǎn)農(nóng)產(chǎn)品時就無法取得增值稅發(fā)票，因此1993年《條例》第八條規(guī)定，購進(jìn)免稅農(nóng)業(yè)產(chǎn)品準(zhǔn)予抵扣的進(jìn)項稅額，按照購買價格10%的扣除率計算。農(nóng)產(chǎn)品加工企業(yè)增值稅按照17%或者13%的稅率繳納，而購進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品只能按照10%計算抵扣額，由此出現(xiàn)“高征低扣”，成為長期以來企業(yè)反映比較強(qiáng)烈的稅負(fù)問題。
（二）1994年下調(diào)農(nóng)產(chǎn)品初加工企業(yè)增值稅稅率。為扶持農(nóng)業(yè)生產(chǎn)發(fā)展，財政部、國家稅務(wù)總局1994年下發(fā)了《關(guān)于調(diào)整農(nóng)業(yè)產(chǎn)品增值稅稅率和若干項目征免增值稅的通知》（財稅字[1994]4號），規(guī)定從1994年5月1日起，農(nóng)業(yè)產(chǎn)品增值稅稅率由17%調(diào)整為13%.這樣，通過外購農(nóng)產(chǎn)品進(jìn)行加工和銷售的企業(yè)增值稅稅率由17%下調(diào)到13%.但由于這次調(diào)整未涉及增值稅進(jìn)項稅額抵扣問題，因此“高征低扣”問題并沒有得到解決。
�。ㄈ�2002年農(nóng)產(chǎn)品加工業(yè)增值稅進(jìn)項稅抵扣稅率由10%提高到13%.2002年財政部、國家稅務(wù)總局下發(fā)《關(guān)于提高農(nóng)產(chǎn)品進(jìn)項稅抵扣率的通知》（財稅[2002]12號），明確規(guī)定從2002年1月1日起，增值稅一般納稅人購進(jìn)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者銷售的免稅農(nóng)業(yè)產(chǎn)品的進(jìn)項稅額扣除率由10%提高到13%；并在《關(guān)于一般納稅人向小規(guī)模納稅人購進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品進(jìn)項稅抵扣率問題的通知》中明確，加工企業(yè)向小規(guī)模納稅人購買農(nóng)產(chǎn)品的進(jìn)項稅額扣除率也提高到13%.但對于按照17%稅率交納增值稅的加工企業(yè)來說，銷項稅率和進(jìn)項稅額抵扣率還有4個百分點(diǎn)的差距，“高征低扣”問題依然存在。
�。ㄋ模�2011年提出農(nóng)產(chǎn)品增值稅進(jìn)項稅額核定和扣除管理辦法改革試點(diǎn)方案。2011年財政部和國家稅務(wù)總局公布了《農(nóng)產(chǎn)品增值稅進(jìn)項稅額核定扣除管理辦法（征求意見稿）》，一方面將農(nóng)產(chǎn)品進(jìn)項稅額扣除率由現(xiàn)行的13%修改為納稅人再銷售時貨物的適用稅率，即納稅人銷售的貨物適用13%稅率的，則扣除率為13%，納稅人銷售的貨物適用17%稅率的，則扣除率為17%，以期徹底解決“高征低扣”問題。另一方面，該辦法規(guī)定，將農(nóng)產(chǎn)品進(jìn)項稅額核定方式由憑證抵扣核定改為投入產(chǎn)出法、成本法或參照法核定。其中，投入產(chǎn)出法主要是按照單位貨物消耗的原料數(shù)量和平均購進(jìn)價格計算增值稅進(jìn)項抵扣稅額；成本法則是根據(jù)耗用農(nóng)產(chǎn)品占生產(chǎn)成本的比例和主營業(yè)務(wù)成本計算增值稅進(jìn)項抵扣稅額。
二、對現(xiàn)行農(nóng)產(chǎn)品增值稅政策的認(rèn)識歷經(jīng)4次改革和調(diào)整，農(nóng)產(chǎn)品加工業(yè)增值稅政策已經(jīng)逐步完善，“高征低扣”問題得到了一定程度解決，農(nóng)產(chǎn)品加工業(yè)企業(yè)稅負(fù)也大大減輕。但從各地企業(yè)反映看，農(nóng)產(chǎn)品增值稅政策仍然存在一些問題。一是“高征低扣”現(xiàn)象仍然存在。除少數(shù)農(nóng)產(chǎn)品初加工企業(yè)按照13%繳納增值稅外，大部分農(nóng)產(chǎn)品加工企業(yè)按17%的增值稅率繳納增值稅。盡管農(nóng)產(chǎn)品增值稅進(jìn)項抵扣稅率提高到了13%，但與17%的銷項稅率相比，仍然存在“高征低扣”問題。二是優(yōu)惠稅率范圍較小。只有列入1995年財政部國家稅務(wù)總局《農(nóng)業(yè)產(chǎn)品征稅范圍注釋》的農(nóng)產(chǎn)品及其加工品，才能享受到13%的增值稅稅率，而目前大多數(shù)農(nóng)產(chǎn)品加工企業(yè)的產(chǎn)品已經(jīng)超出了注釋范圍，不利于促進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品精深加工業(yè)的發(fā)展，不利于提高農(nóng)產(chǎn)品附加值。三是農(nóng)產(chǎn)品收購專用發(fā)票管理滯后。按照2008年《中華人民共和國增值稅暫行條例》規(guī)定，農(nóng)產(chǎn)品加工企業(yè)只能為種植戶或養(yǎng)殖戶交售自產(chǎn)的農(nóng)產(chǎn)品開具收購發(fā)票，對于農(nóng)民經(jīng)紀(jì)人或商販（小規(guī)模納稅人）則不能開具收購發(fā)票。但在實踐中，大多數(shù)農(nóng)民習(xí)慣通過農(nóng)民經(jīng)紀(jì)人或者商販向企業(yè)交售農(nóng)產(chǎn)品，給企業(yè)收購農(nóng)產(chǎn)品原料帶來了困難；有的地方稅務(wù)部門則要求農(nóng)產(chǎn)品加工企業(yè)按照一定比例代商販補(bǔ)繳增值稅，加重了企業(yè)負(fù)擔(dān)。
三、政策建議
�。ㄒ唬┍M快將農(nóng)產(chǎn)品進(jìn)項稅額扣除率由現(xiàn)行的13%調(diào)整為納稅人銷售貨物的適用稅率。按照2011年財政部和國家稅務(wù)總局《農(nóng)產(chǎn)品增值稅進(jìn)項稅額核定扣除管理辦法（征求意見稿）》的設(shè)計，增值稅進(jìn)項稅額扣除率需采取投入產(chǎn)出法或成本法進(jìn)行核定，但實際操作比較復(fù)雜，短期內(nèi)還難以全面推行。建議增值稅進(jìn)項稅額扣除管理辦法改革試點(diǎn)分兩步推進(jìn)。第一步，繼續(xù)采用農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票憑證直接計算增值稅抵扣進(jìn)項稅額方式，把農(nóng)產(chǎn)品增值稅進(jìn)項稅額抵扣率由現(xiàn)行的13%調(diào)整為納稅人銷售貨物時的適用稅率，先解決“高征低扣”問題，降低農(nóng)產(chǎn)品加工企業(yè)稅負(fù)。第二步，等時機(jī)成熟，適時在全國推廣投入產(chǎn)出法和成本法進(jìn)行增值稅進(jìn)項稅額核定抵扣。
�。ǘ⿺U(kuò)大農(nóng)產(chǎn)品初加工的范圍，進(jìn)一步降低農(nóng)產(chǎn)品加工企業(yè)的稅負(fù)。建議適當(dāng)擴(kuò)大農(nóng)產(chǎn)品初加工目錄范圍，將與人們?nèi)粘Ｉ蠲芮邢嚓P(guān)、對帶動農(nóng)民增收效果顯著的農(nóng)產(chǎn)品加工業(yè)納入初加工范圍，采用13%的增值稅稅率。針對當(dāng)前食品價格上漲的突出問題，建議對從事糧油、肉蛋奶、果蔬等生活必需品加工企業(yè)的增值稅銷項稅率統(tǒng)一調(diào)整為13%，降低企業(yè)成本，穩(wěn)定食品價格，保障市場供給。
�。ㄈ⿺U(kuò)大增值稅進(jìn)項稅額核定扣除辦法改革試點(diǎn)范圍，及時總結(jié)經(jīng)驗。與目前按照收購憑證核定增值稅進(jìn)項抵扣額的方式相比，采用投入產(chǎn)出法和成本法核定增值稅進(jìn)項抵扣額的方法更科學(xué)合理。但不同行業(yè)的加工方式、工藝有較大差異，投入產(chǎn)出法和成本法在各行業(yè)所遇到困難和問題也不盡相同。建議將試點(diǎn)擴(kuò)大到更多的行業(yè)，可以在糧棉油、肉蛋奶等主要行業(yè)各選取若干大型企業(yè)，分別開展試點(diǎn)，進(jìn)行對比分析，總結(jié)經(jīng)驗，按照“科學(xué)合理、操作簡便”的原則選擇合適的操作辦法，進(jìn)一步完善農(nóng)產(chǎn)品加工業(yè)增值稅政策。
